Windows update的出现类似于桌面操作系统更新选项。用户可以通过手动自动方式对系统进行更新。用户不需要和以往一样必须手动下载补丁安装。拥有了Windows update的新一代操作系统，从系统更新机制上真正向前迈进了一步。
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Windows Mobile 6.0对于数据安全性引入了全新加密方式。采用Windows Mobile 6.0操作系统的产品，可以对存储卡部分进行加密处理。经过加密的存储卡，可以有效防止他人读取卡内信息。用户则可以通过实施加密设备，通过ActiveSync才能读取存储卡内信息。
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网页浏览方面，默认情况下Windows Mobile 6.0自带网页浏览器依然无法实现同时多个窗口浏览。
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